（記者王瀟雨）近日，國際期刊《細胞通訊》在線發(fā)表了來自中國科學院動物研究所劉峰團隊及其合作者的論文。他們以斑馬魚尾部造血組織為研究對象，利用多重轉錄組測序，繪制了擴增性造血器官的3D轉錄組圖譜，闡釋了造血干細胞和微環(huán)境細胞之間的分子調控網(wǎng)絡，為造血干細胞擴增的機制研究提供了更多啟示。

研究人員之所以選擇斑馬魚尾部造血組織為解析對象，是由于其在功能上類似于哺乳動物的胎肝。他們采用了3種轉錄組測序方法，即特定類型群體細胞轉錄組、空間轉錄組和單細胞轉錄組，詳細解析了斑馬魚尾部造血組織的時空特性。

具體來說，空間轉錄組測序反映細胞位置信息，揭示了多種微環(huán)境因素對造血干細胞的不同調控方式，并實現(xiàn)了三維轉錄組重構斑馬魚造血器官；單細胞轉錄組數(shù)據(jù)更精細地闡釋了尾部造血組織細胞類群、細胞特征及細胞間分子調控，并發(fā)現(xiàn)造血干祖細胞分化和細胞周期存在一定的關聯(lián)性。同時，多重轉錄組測序綜合分析揭示了造血干細胞在尾部造血組織的擴增受到內源性和外源性信號的共同調控，鑒定了新的造血干細胞的標記基因，發(fā)現(xiàn)了影響造血干細胞擴增的信號通路，完善了造血干細胞—微環(huán)境細胞間分子調控網(wǎng)絡。

此外，研究團隊構建了斑馬魚尾部造血組織多重轉錄組數(shù)據(jù)庫，可檢索特定基因在造血組織的表達譜，包括基因表達的時間、細胞類型及相對空間位置。